La grande variété des manifestations cliniques de la maladie cœliaque entraîne un chevauchement des symptômes avec ceux d’autres troubles : si la diarrhée, les ballonnements et la perte de poids peuvent être observés dans de nombreuses affections gastro-intestinales, les caractéristiques extra-intestinales augmentent encore le nombre d’affections pouvant imiter cliniquement la maladie cœliaque.
Le syndrome de l’intestin irritable (SII) - le trouble gastro-intestinal le plus fréquemment diagnostiqué, dont les symptômes comprennent des douleurs, des modifications du transit intestinal (constipation, diarrhée ou les deux), souvent une distension abdominale et d’éventuelles comorbidités somatiques (céphalées, algies fibriles, dyspepsie) ;
syndrome caractérisé par de multiples symptômes intestinaux et extra-intestinaux liés à la consommation de gluten chez des personnes chez qui le diagnostic de maladie cœliaque a été écarté ;
un trouble lié à une surcharge bactérienne, notamment de l’intestin grêle, qui provoque des diarrhées, des ballonnements et une perte de poids.
récurrence des évacuations caractérisées par des selles molles ou aqueuses ;
le lactose, qui n’est pas digéré, provoque une malabsorption sélective qui se manifeste par une distension et des douleurs abdominales, des diarrhées et du météorisme ;
comme les maladies inflammatoires de l’intestin (MICI) et les colites microscopiques
infection de l’intestin grêle causée par des protozoaires du genre Giardia provoquant des crampes abdominales et des diarrhées.
L’utilisation chronique de substances ou de médicaments tels que, par exemple, la metformine (utilisée pour traiter le diabète), l’olmesartan et les sartaniques, les laxatifs osmotiques, les compléments alimentaires et les boissons alcoolisées peut également donner lieu à des symptômes gastro-intestinaux superposés à ceux de la maladie cœliaque.